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AlphaProteo utilizza l’intelligenza artificiale nella progettazione delle proteine

byBünyamin Furkan Demirkaya
6 Settembre 2024
in Healthcare
Home Healthcare
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AlphaProteo guida una nuova era nella biologia con un innovativo metodo di progettazione proteica che potrebbe trasformare la ricerca biologica. Il nuovo metodo, in contrasto con gli approcci convenzionali per la previsione della struttura proteica, sviluppa nuove proteine ​​che possono legarsi con precisione a molecole specifiche. Questa caratteristica offre opportunità per una varietà di utilizzi nello sviluppo di farmaci, nella ricerca sulle malattie e oltre.

Le proteine ​​sono essenziali per tutte le funzioni biologiche del corpo. Queste macchine molecolari hanno interazioni molto specifiche, simili a come le chiavi si inseriscono nelle serrature, per controllare varie funzioni come la crescita cellulare e le risposte immunitarie. Mentre strumenti come AlphaFold hanno fornito preziosi spunti su queste interazioni, sono carenti quando si tratta di creare proteine ​​completamente nuove progettate per manipolare direttamente questi processi. È qui che entra in gioco AlphaProteo, spingendo i confini di ciò che è possibile nell’ingegneria proteica.

https://deepmind.google/api/blob/website/media/GDM-ProteinDesignBlog-02-Binder-Final.mp4

AlphaProteo dimostra il potere dell’intelligenza artificiale nella scienza

AlphaProteo non si limita a prevedere le strutture proteiche, ma le crea. progettazione di nuove proteine leganti, il nuovo metodo offre ai ricercatori nuovi strumenti per esplorare e manipolare i sistemi biologici. Questi leganti sono non solo teorico; sono stati convalidati sperimentalmente per legarsi strettamente a proteine ​​bersagliorendendoli inestimabili per un’ampia gamma di applicazioni. Dalla progettazione di farmaci alla diagnosi di malattie, AlphaProteo è pronta ad accelerare i progressi in campi che si basano in larga misura sulle interazioni proteiche.

AlphaProteo eccelle nella produzione di leganti altamente efficaci per diverse proteine ​​target, che è una delle sue vantaggi principaliCiò comporta VEGF-Auna proteina legata a cancro E diabete complicazioni, rappresentando l’istanza iniziale di un sistema di intelligenza artificiale che sviluppa un legante proteico per questo target cruciale. Ma le capacità di AlphaProteo non si fermano qui; ha anche dimostrato affinità di legame superiori su sette diverse proteine ​​target, superando di gran lunga i metodi esistenti.

La scienza dietro AlphaProteo

Progettare leganti proteici è un compito complesso che tradizionalmente ha richiesto un ampio lavoro di laboratorio e molteplici cicli di ottimizzazione. Il processo non solo richiede molto tempo, ma è anche pieno di sfide. AlphaProteo cambia le regole del gioco automatizzando gran parte di questo processo. Addestrato su vasti set di dati da Banca dati delle proteine e le strutture previste da AlphaFold, il nuovo metodo ha imparato a riconoscere i modi complessi in cui le proteine ​​si legano tra loro.

Data la struttura di una proteina bersaglio e le posizioni di legame specifiche, AlphaProteo può generare una proteina candidata progettata per legarsi in quei punti precisi. Questa capacità di creare leganti ad alta resistenza su richiesta ha implicazioni enormi per la ricerca, riducendo potenzialmente il tempo e lo sforzo necessari per sviluppare nuove terapie e strumenti diagnostici.

Impatto nel mondo reale

Per mettere alla prova AlphaProteo, i ricercatori hanno progettato leganti per una gamma di proteine ​​bersaglio, tra cui proteine ​​virali come BHRF1 e il SARS-CoV-2 dominio di legame del recettore della proteina spike (SC2RBD), così come le proteine ​​coinvolte in cancro E autoimmune malattie. I risultati sono stati impressionanti: i leganti generati da AlphaProteo hanno mostrato percentuali di successo eccezionalmente elevate, con 88% di molecole candidate che si legano con successo nei test sperimentali.

AlphaProteo utilizza l'intelligenza artificiale nella progettazione delle proteine
Questa attenta strategia è in linea con iniziative più ampie volte a stabilire standard nel campo della biotecnologia basata sull’intelligenza artificiale (Credito immagine: Google DeepMind)

Questi risultati non erano solo teorici, ma sono stati convalidati attraverso una rigorosa sperimentazione. In collaborazione con gruppi di ricerca del Istituto Francis Crickil team AlphaProteo ha confermato che i leganti progettati hanno funzionato come previsto. Ad esempio, alcuni dei SC2RBD i leganti sono stati in grado di impedire la SARS-CoV-2 virus e alle sue varianti di infettare le cellule, dimostrando l’utilità pratica di questa tecnologia.

Tuttavia, AlphaProteo non è privo di limiti. Sebbene abbia funzionato bene nella maggior parte delle valutazioni, ha incontrato difficoltà nel creare leganti per TNFɑ, una proteina legata a condizioni autoimmuni come l’artrite reumatoide. Questo ci ricorda che AlphaProteo, nonostante la sua potenza, non è privo di difetti. Il team è impegnato a migliorare il sistema e ad aumentare la sua capacità di affrontare obiettivi difficili.

Sviluppo responsabile e prospettive

AlphaProteo ha un’ampia gamma di potenziali utilizzi, dal miglioramento della nostra conoscenza delle malattie alla creazione di farmaci e diagnosi migliori. Tuttavia, un grande potere comporta una grande responsabilità. I ​​creatori di AlphaProteo sono altamente consapevoli dei pericoli per la biosicurezza legati alla creazione di proteine ​​e stanno collaborando con specialisti esterni per garantire che la tecnologia venga sviluppata e distribuita in modo responsabile.

Questa attenta strategia si allinea con iniziative più ampie per stabilire standard nell’area della biotecnologia basata sull’intelligenza artificiale. Il team AlphaProteo si impegna a utilizzare la sua tecnologia per il beneficio della società e a ridurre i potenziali rischi lavorando con la comunità scientifica e collaborando con diversi campi.

Guardando al futuro, il team è entusiasta delle possibilità che AlphaProteo presenta. Stanno già esplorando le sue applicazioni nella progettazione di farmaci attraverso collaborazioni con Isomorphic Labs e continuano a migliorare gli algoritmi del sistema per aumentare il suo tasso di successo ed espandere la sua gamma di capacità.

AlphaProteo utilizza l'intelligenza artificiale nella progettazione delle proteine
Sta aiutando a sviluppare nuove terapie contro il cancro, prevenire le infezioni virali e svelare i segreti di malattie complesse (Credito immagine: Google DeepMind)

Cambiare la ricerca biologica

AlphaProteo è un nuovo modo di fare ricerca biologica. AlphaProteo aiuta a creare nuove proteine ​​che si legano a target specifici. Ciò potrebbe portare a nuovi farmaci, a una migliore diagnosi delle malattie e altro ancora. È un punto di svolta nel campo perché funziona ed è migliore di altri metodi.

COME ricercatori utilizzare AlphaProteo di più, sta diventando chiaro che questa tecnologia cambierà il modo in cui comprendiamo e interagiamo con il mondo biologico. Il nuovo metodo è destinato a svolgere un ruolo cruciale nel futuro della scienza e della medicina.

Sta aiutando a sviluppare nuove terapie contro il cancro, prevenire infezioni virali e svelare i segreti di malattie complesse. Sebbene le sfide rimangano, i progressi compiuti finora mostrano il potenziale della progettazione proteica guidata dall’intelligenza artificiale. AlphaProteo aprirà senza dubbio nuove strade di ricerca e innovazione, rendendolo uno strumento indispensabile per gli scienziati di tutto il mondo.


Credito immagine in evidenza: Google DeepMind

Tags: AlfaProteoIn primo pianoIntelligenza artificialeprogettazione proteica

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